لمحمد بن علوي ولدان هما: زاخر ومحمد سمي على أبيه حيث توفي وهو في بطن أمه، فيجتمع في زاخر آل بسام بن منيف، وآل بسام بن عساكر، وآل راجح، وآل ريِّس، وآل بسام بن عقبة، والمشارفة، والريايسة، ويجتمع في آل محمد بن محمد آل خرفان والشبارمة ومنهم الشيخ محمد بن مانع.